但现在青州发生叛乱，人民军都己经开进了青州城里，也就不能再按以前的计划步骤按部就班的进行，必须像济南那样成立青州地方政府。而这就需要从济南、青岛抽调一些有城市管理经验的穿越者到青州去任职，因此人员的调遣安排也要列入计划中。
而对付清廷的决议是双管齐下，首先是以山东巡抚的名议上折清廷，将这次青州叛乱定性为造反，华东政府是出兵平乱；而在私下里则是和清廷进行交涉，指责文瑞反对穿越者在山东的统治，要求清廷承认穿越者的行动，将青州驻守八旗军的行为定为造反，这样双方就都有台阶可下。这样也可以告戒山东的各地方官员、势力，在这一亩三分地上，朝廷己经沒有任何权威，只能为华东政府背书。
虽然穿越者和清廷己经达成了协议，山东实际是等于独立了，但在名议上穿越者仍然是清廷的臣下，并且还受封山东巡抚，这就给了山东的地方官员、地方乡绅们一个错觉，认为朝廷对海外华人还有一定的约束力，甚致是能对山东的事务进行干涉。而这样一来就容易对清廷抱以不切实际的幻想，认为朝廷早晚会收拾海外华人，或者是把事情闹大，朝廷就会出面管一管海外华人。
尽管穿越者在山东的统治一直都在，尽力淡化清廷的影响，但毕竟是时间尚短，去清廷化的成效还并不明显，这次青州之乱，正是因为文瑞等人还怀着这样的幻想才发生，如果文瑞知道清廷在山东的形响力基本为零，恐怕就不会轻举妄动了。而穿越者正好可以借这一次事件，打消人们的这种不切实际的幻想。
当然如果清廷拒绝认定青州驻守八旗军造反，相反还想借机打击、削弱穿越者在山东的统治，那么华东政府也就不客气，索性正式独立，不在承认清廷。
虽然这样的后果对双方都不利，但相比之下，清廷更无法承受这个结果。因为对华东政府来说，虽然失去了大名份的正当性，但毕竟己经建立了一支属于自己的武装军队，手里有枪，心里不慌，大不了就以武力压服，相反没有清廷这层皮，穿越者的行动也就更自由，大可以直接废除掉淸廷的地方官员，直接建立华东政府的行政体系，不用再玩什么架空之类的把戏。
而对清廷的立场来说，和穿越者撕破了脸，是百害而无一利的，从收益的角度说基本为零，难道说清廷现在还有力量出兵来进攻山东，消灭穿越者吗？相反山东紧邻直隶，而且天津还有一半在穿越者手里，一但双方反目为仇，北京几乎就在人民军的兵锋威摄之下，慈禧恐怕是要随时准备再跑路了。退一步来说，就算双方不发生战斗，但天津出海口在穿越者手里，只要是把漕运截断，清廷也受不了。
这么看来，清廷根本就没有和华东政府翻脸的本钱，这一来华东政府还可以借机开出自己的条件，一是向清廷提出要詹天佑，二是最好让清廷撤走山东的官员，让穿越者能够顺利的接管山东。