而当时还只是少将的罗日杰斯特文斯基向沙皇建议，要扭转远东的局面，只增陆军是不够的，而应该海陆齐进，现在俄囯共有三支舰队，分别是亚洲的太平洋舰队、欧洲的波罗的海舰队、黑海舰队，虽然现在太平洋舰队的剩余军舰被困在旅顺港里，无所做为，但波罗的海舰队、黑海舰队的实力犹在，而且现在欧洲方面的局势较为缓和，这两支舰队留在港里也无事可做，到不如派一支到远东去，和太平洋舰队合并，重新提升俄国在远东地区的海军实力，这样海陆并进，就可以扭转胜局了。
虽然绝大部份人对罗日杰斯特文斯基的建议都嗤之以鼻，认为这个建议的可操作性极低，因为无论是波罗的海还是黑海，到远东的航程都接近3万公里，而且俄国在途中没有任何基地港口接应，提供补济，因此既使是把舰队免强开到远东，也将精疲力竭了,没有几个月的修整，是根本不可能战斗的，而日本会给俄国舰队修整的时间吗。
但尼古拉二世对这个建议却很感兴趣，认为这是扭转远东局势的重要步骤，于是立刻下令，以波罗的海舰队为主，辅以部份黑海舰队，组成第二太平洋舰队，开赴远东参战。
本来沙皇任命波罗的海舰队司令彼里吕耶夫中将担任第二太平洋舰队的司令官，但久经事故的中将深知这一趟是凶多吉少，到不到得了远东还不好说，既使到了也未必就能改变远东的局势，于是以患病为由拒绝了这一任免。而沙皇改命提出这个建议的罗日杰斯特文斯基为司令官。虽然这时罗日杰斯特文斯基的军衔还是少将，不够出任舰队司令官的资历，但沙皇大笔一挥，把罗日杰斯特文斯基提升为中将，十分容易的就解决了资历的问题。
收到了这个消息之后，首先是日本政府首脑们意识到，自己把事情想得太乐观了，俄国可不是清廷，俄国拥有50于日本的领土；10倍于日本的国家收入；3倍于日本的人口数量，不是几场败仗就会轻易屈服的。这不马上就又组织起一支不逊于太平洋舰队的新舰队来。
虽然现在太平洋舰队被封锁在港口里，但这并不表示太平洋舰队就无力再战了，现在太平洋舰队仍然还有5艘战列舰，1艘装甲巡洋舰，实力不容小视，只是缺少辅助护卫舰只，才无力出港应战。
而第二太平舰队里有大量的辅助舰船，因此双方但汇合，将组成一支拥有12艘战列舰，3艘装甲巡洋舰、6艘防护巡洋舰、9艘驱逐舰的庞大舰队，实力将远凌架于日本联合舰队之上，海权是肯定保不住了，而一但失去制海权，日本将必败无疑。
于是日本内阁、陆军大本营，海军军令部等部门赶紧展开联合协商，最终做出决议，要在第二太平洋舰队到达远东之前，攻占旅顺、歼灭太平洋舰队，并且攻占奉天，确定自己的绝对优势，只有这样，等第二太平洋舰队到达远东以后，日本还有和它一战的机会。而其中的重中之重就是攻占旅顺，歼灭太平洋舰队。
陆军大本营也感到了严重的压力，毕竟现在太平洋舰队躲在港口里不出来，只有攻占旅顺之后，才有歼灭太平洋舰队的机会。于是大本营也开始正式讨论是否更换乃木希典的问题，毕竟旅顺攻不下来，主将是难辞其咎的。
但明治天皇认为，临阵换将是兵家大忌，而且在这个时候撤换乃木希典，对他无疑是巨大的羞辱，估计乃木希典会真的自杀来维持自己的尊严，但像乃木希典这样的高级军官因战事不利而自杀，对军队的士气将是沉重的打击，因此大本营决定还是再给乃木希典一次机会。
而且大本营也认为，虽然以前乃木希典没能攻下旅顺，但连续两次进攻，肯定也旅顺的守军造成了重大的损失，由其是消耗了守军大量的弹药，因此估计现在旅顺的守备力量以被大大削弱，也许再有一次进攻，就可以攻下旅顺了。不如仍然将这个机会让给乃木希典。