为了避免四魂之玉落入有邪念的人手中，桔梗嘱咐妹妹枫将四魂之玉与自己的尸体一起烧掉。
桔梗死后奈落多次寻找四魂之玉的都无果。
桔梗死后的五十年，一名叫做日暮戈薇的少女在15岁当意外地被妖怪拉进“食骨之井”，穿越了时空进入古代的战国时代。
并与被桔梗封印在神树下的犬夜叉相遇，无意间解开了犬夜叉身上的封印使其复活。
而拥有无限妖力的“四魂之玉”原来藏在戈薇的体内（戈薇是桔梗的转世，桔梗死后带着四魂之玉一同转世到戈薇的体内。）
但一次与妖怪的争夺战里，“四魂之玉”破碎开来分散于各地，戈薇与犬夜叉两人因而踏上搜集碎片之旅。
后来桔梗被里陶鬼的以鬼术抽取转世灵魂使之复活。
为撩到四魂之玉，奈落利用与犬夜叉争夺父亲遗物“铁碎牙”的杀生丸，利用一只镶有四魂之玉碎片的人类手臂给杀生丸，让兄弟二人厮杀并趁机准备了毒虫之巢对付弥勒的风穴。
得到奈落帮助的杀生丸果然抢到了铁碎牙，而失去铁碎牙犬夜叉则入了苦战，但犬夜叉牺牲自己的身体，扯下杀生丸的假手抢回了铁碎牙，让杀生丸知难而退，撤退后的杀生丸知道了奈落的诡计撕下了镶有四魂之玉碎片的人类手臂并击退了奈落。
但奈落诡计多端，在知道无法利用杀生丸来杀害犬夜叉一行人后，利用诡计将驱魔师村子的珊瑚一行人骗到城里收妖，并控制了珊瑚的弟弟琥珀来杀害了自己父亲及其同伴，并重伤了珊瑚，之后奈落欺骗珊瑚谎称一切都是犬夜叉的所为，愤怒的珊瑚信以为真带着重伤寻找犬夜叉报仇，但之后被戈薇揭穿了真相。
为了替自己的家人报仇珊瑚加入了犬夜叉一行饶队伍，但奈落利用四魂之玉的碎片复活了珊瑚的弟弟琥珀，并威胁珊瑚偷走犬夜叉的铁碎牙。
但得到铁碎牙后的奈落命令琥珀对珊瑚动手，但没想到珊瑚宁可牺牲性命也要保护弟弟。
之后犬夜叉一行人赶到现场，陷入窘境的奈落无计可施，利用瘴气夹带着琥珀逃离了现场。
奈落为了尽快收集四魂之玉，制造了分身神乐和神无，来帮助自己夺取四魂之玉，但神乐并不听从奈落的指挥，奈落则将神乐的心脏作为要挟，命令神乐。
后来奈落解除了曾经与犬夜叉父亲“犬大将”发生大战的大妖怪龙骨精的封印，并告诉龙骨精犬夜叉是犬大将儿子让龙骨精为自己报仇，之后犬夜叉与龙骨精发生了战斗，在龙骨精的压倒性的巨大妖力下犬夜叉陷入了下风，但在最后关头犬夜叉领悟了铁碎牙奥义“爆流破”的犬夜叉，最终用“爆流破”将龙骨精彻底消灭。
后来奈落得知鬼蜘蛛的心一直还活着，奈落想要舍弃掉这颗没意义的心所以创造出无双，可是奇怪的是奈落却想保护无双，而且还要把无双吸进身体里面（原来因为失去无双的奈落让自己的妖力也变弱，于是奈落再一次把无双吸进体内。）
之后奈落吸收了大量的妖怪并大幅度得增强了自己的妖力。
后来奈落假神乐之手，掳走玲，引杀生丸进入奈落城，但犬夜叉一行人进入城内并击败奈落，败北后的奈落将杀生丸吐出，玲和琥珀因而获救，但奈落从此下落不明。
消失多日后的奈落利用四魂之玉碎片复活了在数十年前被斩首的支雇佣兵队伍，并命令佣兵队长蛮骨帮助自己消灭犬夜叉一行人。
之后桔梗追踪到奈落的下落，在白灵山崩时找到奈落，追问奈落何以要在白灵山圣地布下结界，杀害无辜，奈落在回答她完全为了壮大自己，主宰自己的命运后将桔梗推入山崖生死不明。
被奈落推入白灵山的桔梗并没用死去，并处处帮助犬夜叉一行人对抗奈落。
奈落为了除掉心头之患桔梗，要白童子不择手段引伤势还未痊愈的桔梗出来，于是白童子带着琥珀利用厨子鼠的特性，不断释放出老鼠袭击村庄吃光了所有的地方，桔梗使用聚魔术将厨子鼠聚集到灵树中，但奈落趁机利用蜘蛛丝污染了桔梗，为了拯救村民的性命桔梗终于失去了生命。
桔梗死后奈落为了夺取最后的四魂之玉碎片而现身，虏获了戈薇，犬夜叉他们为之苦战。
琥珀用桔梗留下的最后一丝光和戈薇的破魔之箭给了奈落一击，但是却被奈落夺走了四魂之玉碎片而气绝。
珊瑚因为琥珀的死而悲痛欲绝，但后来因为桔梗的灵力琥珀获得了重生。
得到四魂之玉的奈落，终于露出了自己的本体，化身成一只巨大的蜘蛛妖怪，犬夜叉一行人进入奈落的体力与奈落发生了最终决战，最终奈落被戈薇的破魔之箭穿体而死。
在临死前奈落向四魂之玉许愿当戈薇的心败给黑暗之时，和戈薇在四魂之玉中展开新的灵魂之战。
但在戈薇就要许下错误的愿望时，犬夜叉来到了，并与戈薇许下了正确的愿望“让四魂之玉永远的消失”。
在最后奈落终于懂得了自己原来一直深爱着桔梗，并带着这个思想彻底安息。
此刻的奈落乃是近乎全胜时期的奈落，其强大的力量完全不会输于杀生丸太多。
之所以没有成为十名神灵中的领头两人，一方面是因为绝对实力的确不如杀生丸和长门，另一方面也是奈落深喑低调之道。
知道去争那头领之位没有什么用处，反而还会得罪强大而极具资的杀生丸