轩辕氏回到部落，想道自己该做的均已做完。便想求长生之术，于是向广成子、玄女询问修道养生之法，如此数年后，轩辕写下了阴符经、黄帝太乙门入式诀、黄帝太一门入式秘诀、黄帝太一门逆顺生死诀。
以他的顺位，应该成为人皇，集人族天地人三皇之称，但是人皇之名为人族的共主，就算是以轩辕的功绩也不可能一直称自己是人皇。
所以自封黄帝，而修炼内功的集合为黄帝内经，黄帝内经里面包罗万象，有着公孙轩辕对于武道，仙道，医药，人体各种的了解，而其余的集合为黄帝外经。
当然，黄帝内经当中最为出名的就是黄帝自己研究出来的阴阳大道，御女成道，为了让自己的黄帝内经圆满，除了之前找的那几个妻子，加起来一共三千妻子。
一天，轩辕细数着自己的日子，细细算来已经一千一百多年了，离一千二百年已经快到了，但是他始终觉得自己还是缺了些什么，就连那些九黎之人还没有并入人族当中。
而蚩尤在押回来的那天就已经斩首了，却没想到斩首之后，蚩尤居然还没有死，突然一阵诡异的笑声响起，轩辕黄帝惊骇无比的望去，只见蚩尤那无头之躯根本没有流下一丝鲜血，那被斩下的头颅正在疯狂的大笑着
“哈哈哈公孙轩辕，本座早就说过，吾乃不死之身，即便是那轩辕圣剑也休想斩杀我蚩尤哈哈”
蚩尤笑罢，口中喃喃念诵着什么，那被斩落的头颅瞬间飞至断颈处光华一闪，再次紧密无间的联系在一起
轩辕黄帝看着这诡异无比的景象，心中没有丝毫的波澜，不过面上却是十分焦急，道：“蚩尤，即便你有此保命神通，今日你也死定了”言罢，再次挥动手中的轩辕圣剑将那蚩尤的头颅以及四肢斩下
那被斩下的身体部分还在活动，蚩尤头颅笑道：“公孙轩辕，无论你斩一万次还是无数次结果都一样，吾修成了无相元神，元神不灭，吾便是不死之身”
轩辕黄帝紧皱眉头，心中苦苦思索，看向广成子。
这时那广成子说道：“陛下，贫道师弟赤n有一宝贝，名曰阴阳镜，定可克制这蚩尤”
轩辕黄帝大喜，望向赤n道：“还请师叔相助”
赤n闻言淡笑道：“陛下不必客气，贫道自当相助”言罢，取出阴阳镜，白红二色闪烁不断，把白色的一面照射在蚩尤的身上
只见蚩尤在白光的照射下，依然无所畏惧，面带笑意的望向众人
“怎么可能，阴阳镜竟然不起作用”赤n大惊失色
众仙亦是大惊，忍不住暗道：难道这蚩尤真是不死之躯吗？
此时位于九天之上的天庭中，在一方圆镜中亦是闪现出这一幕景象，那玉皇大帝笑道：“帮助人皇完善三皇之功，此乃无上之功德，如今人皇袖手无策吾却是应该相助一二”言罢，取出道祖鸿钧所赐的宝贝，昊天镜
就在众仙暗暗苦恼之际，只见天际上却是飘来一朵祥云，轩辕黄帝看去只见那祥云上有着一个镜子，九天玄女连忙说道：“陛下，这是玉帝的宝镜可相助人皇陛下斩杀蚩尤，建立不世之功。”很明显昊天已经说了这昊天镜的用法。
轩辕黄帝大喜不已，闻言谢道：“玉帝，轩辕多谢了”
九天玄女点了点头，手持昊天镜对准蚩尤，只见镜子闪烁出一层毫光，光华一闪照射在蚩尤的身上，蚩尤立马感觉到一股危机感传来，自身修成的无相元神瞬间被一股玄奥的力量所封印
心中惊恐不已，望向那宝镜眼中露出浓浓的恐惧
轩辕黄帝手持轩辕剑上前一剑斩下蚩尤的头颅，只见这时蚩尤身躯终于流出鲜血，轩辕大喜又连斩四剑斩下蚩尤的四肢
那广成子道：“这蚩尤不知修炼的何种神通，竟然这般诡异，为了日后避免其复活还是将他身躯分别置放在天地五处，借助天地之力镇压”
轩辕黄帝道：“老师此举大善，就依老师之言”
却是命人找来龙马，将蚩尤的头颅，四肢连接的躯干部分运送到五岳之地，在辅以无数阵法禁止将封印之地布置的固若金汤，日夜命人看守。
回想起当时和蚩尤的约定，想了想，避过了所有人，来到了封印蚩尤头颅的泰山当中，走进了一个山洞里面，布下的阵法对于轩辕来说几乎时没有作用的。
而在阵法的最深处，一个身躯魁梧的人影盘做着，看见轩辕，道：“如何，还有什么事情吗？”这人正是蚩尤，可是轩辕之所以镇压蚩尤在五岳当中，是为了一个计划。
而也是后土娘娘曾经与他的交易，只要蚩尤的头颅加四肢能得到五岳的滋养，到时候成就大帝就会比较简单。蚩尤知道了后土娘娘的安排，也不再反对，而且轩辕打算在泰山立下祭坛，成就人皇，蚩尤也会得到一部分功德，因为他是主动融入轩辕。
在轩辕庞大的功德之下，他获取的功德几乎不可见，但是这只是一个引子，为了蚩尤的元神能脱离身躯，让蚩尤的肉身在五岳当中，自己的元神还有别的事情要做。
只是蚩尤不知道为什么轩辕还要来此，“九黎之人在雨师和风伯的带领下，消失不见了，可能去了地府，但是九黎是人族的一大族，要是这样人族就不算统一。”
“地府，怎么会去那里了，莫非是烛九阴祖巫要求的，当是我要求他们就是等一段时间就加入你的。”蚩尤皱起眉头，当时他留下的信息可不是这样的。